Scientific Agent Skills

Scientific Agent Skills（原 Claude Scientific Skills）是一个包含 163 项即用型科学和研究技能的开源集合，由 K-Dense 创建并维护。它旨在将支持开放 Agent Skills 标准的 AI 代理（如 Claude Code, Cursor, Codex, Gemini CLI 等）转变为能够执行复杂多步科学研究工作流的专业助手。

该套件不仅限于生物学或医学，还广泛覆盖化学、物理学、工程学、地理空间科学及数据分析等领域，为科研人员提供经过验证的代码示例、数据库访问路径和最佳实践指南。

核心亮点

• 全学科覆盖：涵盖生物信息学、药物发现、临床医学、蛋白质组学、医疗 AI、材料科学、天文学、工程仿真等 16+ 个主要科学领域。
• 100+ 数据库集成：通过统一的 database-lookup 技能及专用适配器，提供对 PubChem, ChEMBL, UniProt, ClinicalTrials.gov, FRED 等 78+ 公共数据库的确定性访问。
• 70+ 优化 Python 包技能：为 RDKit, Scanpy, PyTorch, scikit-learn, BioPython, OpenMM 等主流科学计算库提供版本感知的工作流指导，显著降低 API 学习成本。
• 9 大实验室平台集成：预文档化的 Benchling, DNAnexus, LatchBio, Opentrons 等平台技能，加速实验室自动化与数据管理。
• 安全与合规：每个技能均附带测试套件，并通过 CI 进行结构化验证。定期使用 Cisco AI Defense Skill Scanner 进行安全扫描，确保代码执行的安全性。

适用场景

快速开始

选项 1：使用 npx（推荐，通用安装）

适用于 Claude Code, Codex, Cursor, Gemini CLI 等支持标准的主机：

npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills

选项 2：使用 GitHub CLI (gh skill)

如果你安装了 GitHub CLI v2.90.0+：

# 交互式浏览并安装
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills

# 直接安装特定技能（例如 scanpy）
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills scanpy

# 指定代理主机
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills --agent cursor

选项 3：手动克隆（适用于所有主机）

# 用户级安装
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git ~/.agents/skills/scientific-agent-skills

# 项目级安装
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git .agents/skills/scientific-agent-skills

⚠️ 安全与免责声明

Agent Skills 具有执行代码、安装包和发起网络请求的能力。为了保障你的系统安全：

1. 按需安装：建议只安装你当前工作需要的特定技能子集，而非一次性安装全部 163 项。
2. 审查文档：在安装前阅读 SKILL.md，了解其功能及调用的外部服务。
3. 本地扫描：可使用 cisco-ai-skill-scanner 在本地对第三方技能进行安全扫描。
4. 信任来源：优先使用由 K-Dense 官方维护的技能，社区贡献的技能虽经审查但仍需保持警惕。